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生兴生物技术(南京)有限公司
Sunshine Biotechnology (Nanjing) Co.,Ltd.
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RNAi技术服务
      近年来的研究表明,将与mRNA同源的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,从而抑制其相应基因的表达。这种转录后基因沉默机制(Post-transcriptional gene silencing, PTGS)被称为RNA干扰(RNAi)。由于RNAi具有高度的序列专一性,可以特异地使特定基因沉默,获得功能丧失或降低突变,因此RNAi可以作为一种强有力的研究工具,用于功能基因组的研究。我们应用国外知名公司的RNAi Designer平台,可对靶基因序列进行干扰位置效应评价和序列同源型分析,完成siRNA/miRNA多种序列的的设计,并提供从siRNA合成、RNAi载体构建到RNAi功能验证等全面的RNAi解决方案。

服务类别
1、siRNA合成: 对于瞬时基因沉默实验,化学合成siRNA的方法操作简便,容易获得高水平的瞬时沉默效果,特异性强。我们通过严格设计来增强siRNA的专一性;针对某靶基因设计的3条siRNA可保证其中两条的Knockdown效率达到75%(在转染效率大于80%的情况下)。
A :普通siRNA:均有HPLC纯化,100%除去尚未配对的单链 ;
B :化学修饰siRNA:利用2’-Fluoro或2’-Ome修饰以提高siRNA在血清和培养基种的稳定性,作用时间长于普通siRNA;
C :荧光标记siRNA;
D :siRNA对照,包括普通阴性对照(与目的靶细胞中所有基因无同源性的阴性对照)、荧光标记的阴性对照(更容易观察,可以方便地在荧光显微镜下观察转染的效率,有利于优化转染条件)和siRNA阳性对照(作为一个实验系统检查,确保在您的实验方法是可靠的;常用的siRNA阳性对照有LaminA/C,Beta-Actin,P53,GAPDH等) 。
2、microRNA干扰载体构建:RNAi载体表达可以稳定地研究基因功能,载体在细胞种持续抑制靶基因的表达可达数星期甚至更久。 RNAi载体利用细胞内源性的miRNA加工机制,相比传统shRNA载体可更高效地表达RNA发夹结构,并具有采用GFP进行表达追踪的优点。每个基因设计的4条序列我们保证至少有2条可以达到至少70%转录水平的Knockdown效率(在转染效率大于80%的情况下)。
3、RNAi干扰效果检测:应用RT-PCR方法检测mRNA水平的基因敲除效果;通过Western blot方法检测蛋白水平的基因敲除效果。

具体描述
1.1 siRNA合成

在RNAi效应阶段,siRNA双链结合一个核酶复合物从而形成所谓RNA诱导沉默复合物(RNA-induced silencing complex,RISC)。激活的RISC通过碱基配对定位到同源mRNA转录本上,并在距离siRNA 3’端12个碱基的位置切割mRNA。

实验流程:
1)根据序列信息,进行化学合成
2)纯化及定量
3)冻干处理
4)细胞转染预实验,优化转染条件
5)瞬时转染或稳定转染
6)RT-PCR或Western blot检测转染后某一时间点靶基因的RNA水平或蛋白水平的变化

客户提供:
1)  目的基因的Accession Number(Human、Mouse或Rat种属)以及技术要求(包括OD和nmols的精确数量、纯化类型和修饰要求等)
2)  细胞株和详细的细胞培养的操作步骤
3)  一抗(如果需要Western blot检测)

我们提供:
1)转染效率分析
2)Knockdown结果

质量保证:
针对某靶基因设计的3条siRNA可保证其中2条的Knockdown效率达到75%(在转染效率大于80%的情况下)。

1.2 microRNA干扰载体构建

      RNAi可通过直接向细胞内导入化学合成siRNA或将编码发夹RNA靶序列的双链DNA oligo克隆至载体中再转染至细胞内,相对于前者成本高、持续表达时间短的缺陷,国外知名公司的 miR RNAi表达载体采用Pol Ⅱ启动子表达人工设计的小RNA(miRNA),后者从长的转录本被加工,可表达出与目的基因100%同源的人工化的miRNAs,对靶基因进行切割进而导致特异性的mRNA的降解。此外,该载体还具有以下优点:超过70%的基因沉默效率;miRNA靶序列在哺乳细胞中的瞬时表达或持续表达;更便捷的GFP荧光检测手段,方便追踪miRNA的表达。

实验流程:
1)针对特定基因,设计miR RNAi序列,合成该序列并退火生成双链DNA
2)将DNA与载体连接并转化
3)测序验证miRNA序列的正确性
4)细胞转染预实验,优化转染条件
5)瞬时转染或稳定转染
6)RT-PCR或Western blot检测转染后某一时间点靶基因的RNA水平或蛋白水平的变化

客户提供:
1)  目的基因的Accession Number(Human、Mouse或Rat种属)
2)  细胞株和详细的细胞培养的操作步骤
3)  一抗(如果需要Western blot检测)

我们提供:
1)  构建好的表达载体和相应的甘油菌;赠送阴性对照甘油菌
2)  测序报告
3)  转染效率分析
4)  Knockdown结果

质量保证:
针对某靶基因设计的3条miRNA序列,在转染效率>80%的前提下,我们保证至少有1个克隆可以达到70%转录水平的沉默效率。